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Coronavirus: implicazioni per l’origine del virus e il legame del recettore

Posted on Giugno 18, 2022 by Andrea

Decorso clinico ed esiti di pazienti critici con polmonite da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> a Wuhan, in Cina: uno studio osservazionale retrospettivo monocentrico.<AbstractText> Continua epidemia di <em> coronavirus grave </em> <em> 2 </em> polmonite da distress respiratorio acuto (<em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em > 2 </em>) è iniziata il 19 dicembre a Wuhan, in Cina.

  1. Le informazioni sui pazienti critici con infezione da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> sono scarse. Il nostro scopo era descrivere il decorso clinico e gli esiti di pazienti critici con polmonite da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em>. </AbstractText> <AbstractText> In questo centro unico, uno studio osservazionale retrospettivo ha incluso 5 <em> 2 </em> pazienti adulti in condizioni critiche con <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> polmonite, che sono stati ricoverati nell’unità di terapia intensiva (ICU) del Wuhan Jin Yin-tan Hospital (Wuhan, Cina) tra la fine di dicembre <em> 2 </em> 019 e <em> 2 gennaio </em> 6 , <em> 2 </em> 0 <em> 2 </em> 0.
  2. Sono stati raccolti dati demografici, sintomi, valori di laboratorio, comorbidità, trattamento ed esiti clinici. I dati sono stati confrontati tra i sopravvissuti e i non sopravvissuti.
  3. Il risultato principale era <em> 2 </em> mortalità a 8 giorni al 9 febbraio, <em> 2 </em> 0 <em> 2 </em> 0. Gli esiti secondari includevano l’incidenza di <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> – <em> Associated </em> Distress respiratorio acuto (ARDS) e la proporzione dei pazienti che necessitano di ventilazione meccanica.
  4. </AbstractText> <AbstractText> Dei 710 pazienti con <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> polmonite, 5 di <em> 2 </em> nei pazienti adulti sono stati inclusi in condizioni critiche.
  5. L’età media di 5 <em> 2 </em> pazienti era di 59,7 (SD 13,3) anni, 35 (67%) erano maschi, <em> 2 </em> 1 (40%) avevano una malattia cronica, 51 (98 %) aveva la febbre. 3 <em> 2 </em> (61,5%) i pazienti sono deceduti <em> 2 </em> 8 giorni e il tempo mediano dal ricovero in terapia intensiva (ICU) al decesso è stato di 7 (IQR 3-11) giorni per i sopravvissuti.
  6. Rispetto ai sopravvissuti, i sopravvissuti erano più anziani (64,6 anni [11 <em> 2 </em>] vs 51,9 anni [1 <em> 2 </em> 9]), con maggiori probabilità di sviluppare ARDS (<em> 2 </em> 6 [81%] pazienti contro 9 [45%] pazienti) e con maggiore probabilità di ricevere la ventilazione meccanica (30 [94%] pazienti contro 7 [35%] pazienti), in modo invasivo o non invasivo.
  7. La maggior parte dei pazienti presentava una compromissione della funzione d’organo, inclusi 35 (67%) con ARDS, 15 (<em> 2 </em> 9%) con danno renale acuto, 1 <em> 2 </em> (<em> 2 </em> em> 3%) con danno cardiaco, 15 (<em> 2 </em> 9%) con disfunzione epatica e uno (<em> 2% </em>%) con pneumotorace. 37 (71%) pazienti hanno richiesto la ventilazione meccanica.
  8. L’infezione nosocomiale si è verificata in sette (13,5%) pazienti. </AbstractText> <AbstractText> Il tasso di mortalità dei pazienti critici con polmonite da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> è significativo. È probabile che il tempo di sopravvivenza per i non sopravvissuti sia di 1 <em> 2 </em> settimane dopo il ricovero in terapia intensiva.
  9. I pazienti più anziani (> 65 anni) con comorbidità e ARDS sono ad aumentato rischio di morte. La gravità della polmonite da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> grava pesantemente sulle risorse di terapia intensiva degli ospedali, soprattutto se mancano di personale o risorse adeguate . </AbstractText> <AbstractText> Nessuno </AbstractText>

Struttura, funzione e antigenicità di <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> glicoproteina spike.

  • L’avvento della <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> ha provocato> 90.000 infezioni e> 3.000 decessi. Le glicoproteine ​​del <em> coronavirus </em> spike (S) facilitano l’ingresso nelle cellule e sono il bersaglio principale degli anticorpi.
  • Mostriamo che <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> S utilizza ACE <em> 2 </em> per l’inserimento cellulare e che i domini di legame del recettore di < em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> S e <em> SARS </em> – <em> CoV </em> S sono associati a simili somiglianze con l’ACE umano <em> 2 </em>, che è correlato all’effettiva diffusione della <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> tra gli esseri umani.
  • Abbiamo scoperto che la glicoproteina <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> S contiene un sito di scissione della furina al confine tra S <sub> 1 </ sub> / S < sub> <em> 2 </em> </sub> subunità che vengono elaborate durante la biogenesi e distinguono il virus da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> e <em> SARS </ em > – <em> correlati </em> <em> CoV </em>.
  • Abbiamo definito le strutture crio-EM del trimero del settore <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em>, fornendo un modello di progettazione del vaccino e inibitori dell’ingresso di virus.
  • Infine, mostriamo che gli anticorpi policlonali murini <em> SARS </em> – <em> CoV </em> S inibiscono fortemente la <em> SARS </em> – <em> CoV </em> – <em> 2 </em> Ingresso cellulare mediato da S, indicando che gli anticorpi cross-neutralizzanti diretti agli epitopi di S. conservati potrebbero essere indotti dopo la vaccinazione.

L’enzima di conversione dell’angiotensina <em> 2 </em> è un recettore funzionale per la <em> SARS </em> <em> coronavirus </em>.

  1. <em> Coronavirus </em> proteine ​​spike (S), incluso <em> Coronavirus </em> che causa <em> grave </em> <em> acuta </em> <em> respiratoria </em > < em> sindrome </em> (<em> SARS </em>) si lega ai recettori cellulari per mediare l’infezione delle cellule bersaglio.
  2. Qui identifichiamo la metallopeptidasi, enzima di conversione dell’angiotensina <em> 2 </em> (ACE <em> 2 </em>), isolato da <em> SARS </em> <em> coronavirus </em> (<em> SARS </em> – <em> CoV </em>) -cellule Vero E6 permissive che legano efficacemente il dominio S1 della proteina S <em> SARS </em> – <em> CoV </em>.
  3. Abbiamo scoperto che la forma solubile di ACE <em> 2 </em>, ma non l’enzima ACE1 <em> correlato </em>, bloccava l’associazione del dominio S1 con le cellule Vero E6. <em> 2 </em> 93 cellule T trasfettate con <em> 2 </em> ACE, ma non quelle trasfettate con i recettori del virus-1 dell’immunodeficienza umana, hanno formato una sincizia multinucleare con cellule che esprimono la proteina S.
  4. Inoltre, <em> SARS </em> – <em> CoV </em> si è replicato con successo in <em> 2 </em> cellule 93T trasfettate con <em> 2 </em> ma non trasfettate in modo simulato. Infine, anti-ACE <em> 2 </em>, ma non anti-ACE1, ha bloccato la replicazione del virus sulle cellule Vero E6. Presi insieme, i nostri dati indicano che ACE <em> 2 </em> è un recettore funzionale per <em> SARS </em> – <em> CoV </em>.
  • <AbstractText> Alla fine di dicembre, <em> 2 </em> 019, sono stati segnalati a Wuhan, in Cina, pazienti con polmonite virale dovuta a un agente microbico non identificato. Successivamente, un nuovo <em> coronavirus </em>, denominato temporaneamente <em> 2 </em> 019 nuovo <em> coronavirus </em> (<em> 2 </em> 019-n <em>, è stato identificato come il patogeno causale CoV </em>). A partire dal <em> 2 </em> 6 gennaio, <em> 2 </em> 0 <em> 2 </em> 0, oltre <em> 2 </em> 000 casi di <em> 2 </em> em > 019-n <em> CoV </em> è stato confermato, la maggior parte delle persone che vivono o visitano Wuhan, con trasmissione da uomo a uomo
  • Abbiamo sequenziato una nuova generazione di campioni di lavaggio broncoalveolare e isolati in coltura da nove pazienti ospedalizzati, otto dei quali hanno visitato il mercato ittico di Huanan a Wuhan. Da questi individui sono state ottenute sequenze genomiche complete e parziali di <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em>. I coni virali sono stati uniti dal sequenziamento di Sanger per ottenere genomi a lunghezza intera, con le regioni terminali determinate dalla rapida amplificazione delle estremità del cDNA. L’analisi filogenetica di questi <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> genomi e altri <em> coronavirus </em> è stata utilizzata per determinare la storia evolutiva del virus e per aiutare a dedurne probabile origine. 

 

</AbstractText> <AbstractText> Le dieci sequenze del genoma <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> ottenute dai nove pazienti erano notevolmente simili, mostrando oltre il 99,98% di identità di sequenza. 

  • Vale la pena notare che <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> era strettamente <em> correlato </em> (con l’88% di identità) a due <em> pesanti </em> derivante da pipistrelli. <em> acuta </em> <em> respiratoria </em> <em> sindrome </em> (<em> SARS </em>) simile a <em> coronavirus </em> es, bat-SL- <em> CoV </em> ZC45 e bat-SL- <em> CoV </em> ZXC <em> 2 </em> 1, raccolti a <em> 2 </em> 018 a Zhoushan, Cina orientale, ma erano più lontani da <em> SARS </em> – <em> CoV </em>
  • Sarbekovirus del genere Beta <em> coronavirus </em>, con un ramo relativamente lungo ai suoi parenti più stretti bat-SL- <em> CoV </em> ZC45 e bat-SL- <em> CoV </em> ZXC <em > 2 </em> 1 ed era geneticamente distinto da <em> SARS </em> – <em> CoV </em>.
  • In particolare, la modellazione dell’omologia ha mostrato che <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> aveva una struttura del dominio di legame del recettore simile a <em> SARS </em> – <em> CoV </em> , nonostante la variabilità degli aminoacidi in alcuni residui chiave. </AbstractText>
  • <AbstractText> <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> è sufficientemente diverso da <em> SARS </em> – <em> CoV </em> per essere considerato nuovo umano – beta infezione da <em>coronavirus</em>.
  • Mentre la nostra analisi filogenetica suggerisce che i pipistrelli potrebbero essere l’ospite principale di questo virus, un animale venduto in un mercato ittico di Wuhan potrebbe fungere da ospite intermedio facilitando l’emergere del virus negli esseri umani.

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È importante sottolineare che l’analisi strutturale suggerisce che <em> 2 </em> 019-n <em> CoV </em> può legarsi al recettore dell’enzima di conversione dell’angiotensina <em> 2 </em> nell’uomo. L’evoluzione futura, l’adattamento e la diffusione di questo virus richiedono un’indagine urgente. </AbstractText>

<AbstractText> Programma chiave nazionale cinese di ricerca e sviluppo, Progetto nazionale cinese di prevenzione e controllo delle malattie infettive su larga scala, Accademia cinese delle scienze, Prima università medica di Shandong. </AbstractText>

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